Подъём каждого затонувшего судна — уникальный процесс. Для каждого из них разрабатывается судоподъёмная документация. В ней описываются виды и способы выполнения работ. Например, используется буксировка к берегу с последующей его утилизацией на берегу или же водолазы погружаются к затонувшему судну, устанавливают внутри судна боны, закачивают их воздухом, чтобы судно начало всплывать на поверхность.

На берегу оборудуется площадка для разделывания судна на части. Металл транспортируется на пункты приёма металла, неметаллические части, а также бункерное топливо и нефтепродукты при наличии вывозятся на полигоны для утилизации.

Безопасность процедуры поднятия и дальнейшей ликвидации обеспечивают боновые заграждения — специальные плавучие барьеры, в основе которых поплавковая часть, ниже — юбка и грузовой элемент. Барьер исключает риск разлива нефтепродуктов и остатков бункерного топлива, которые могут оказаться на борту затонувшего судна. Работы проводятся под наблюдением капитана морского порта, сотрудников Морской спасательной службы, МЧС и Росприроднадзора.

Отметим, что в период с 2025 по 2030 годы по федеральному проекту «Генеральная уборка» национального проекта «Экологическое благополучие» будет ликвидировано 103 судна в 6 субъектах Дальневосточного федерального округа: Камчатском и Приморском краях, Сахалинской и Магаданской областях, Республике Саха (Якутия), Чукотском автономном округе.